Το Ιερό Μετόχι Μεταμορφώσεως του Σωτήρος Χριστού και Αγίου Γεδεών (Μετόχι της Μονής Καρακάλλου Αγίου Όρους) βρίσκεται στην κορυφή χαμηλού υψώματος στο χωριό Μαργαρίτες. Ο ναός του μετοχίου, αφιερωμένος στη Μεταμόρφωση του Σωτήρα Χριστού είναι μονόχωρος, τοιχογραφημένος, αν και σήμερα οι τοιχογραφίες δεν είναι ορατές και χρονολογείται στην περίοδο της Ενετοκρατίας. Στο δάπεδο του ναού υπάρχει τάφος στην καλυπτήρια πλάκα του οποίου διακρίνεται ανάγλυφο το οικόσημο της οικογένειας των Δανδόλων, μιας επιφανούς ενετοκρητικής οικογένειας που συνδέεται με την περιοχή των Μαργαριτών. O ναός ανακαινίσθηκε τον 18ο αιώνα, όπως αναγράφεται σε επιγραφή που υπάρχει πάνω από την πόρτα του.
Σύμφωνα με γραπτές πηγές, ήδη από τις αρχές του 18ου αι. είναι Μετόχι της Μονής Καρακάλλου Αγίου Όρους, ενώ από το 1797 και για έξι χρόνια διέμενε στο Μετόχι ο Οσιομάρτυρας Γεδεών.
Από τις παλιές εγκαταστάσεις γύρω από τον ναό διασώζονται μόνο δύο ισόγεια κτήρια του 18ου – 19ου αιώνα, ενώ νέα λιθόκτιστα κτίσματα κατασκευάστηκαν στις αρχές του 21ου αιώνα, όταν το μετόχι ανασυστάθηκε και επεκτάθηκε.
